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10.1016/j.softx.2015.06.001 · 2015 · External reference
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10.1038/s41589-024-01638-w · 2024 · External reference
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10.1016/j.jgeb.2025.100546 · 2025 · External reference
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10.1016/j.jgeb.2024.100353 · 2024 · External reference
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10.1038/s41598-025-08107-x · 2025 · External reference
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10.1186/1471-2105-7-153 · 2006 · External reference
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10.1111/j.1574-6976.2012.00327.x · 2012 · External reference
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10.1063/1.464397 · 1993 · External reference
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10.1155/2013/263952 · External reference
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10.1186/1745-6150-8-30 · 2013 · External reference
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10.1093/nar/gkz452 · 2019 · External reference
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10.1007/s00894-014-2278-5
10.1007/s00894-014-2278-5 · 2014 · External reference
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10.1016/j.ecoenv.2023.114734 · 2023 · External reference
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10.3389/fimmu.2025.1555741 · 2025 · External reference
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10.1007/s12033-013-9679-z · 2013 · External reference
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10.1186/1471-2105-8-4 · 2007 · External reference
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10.1016/j.humimm.2017.03.005 · 2017 · External reference
10.1016/j.jgeb.2025.100510
10.1016/j.jgeb.2025.100510 · 2025 · External reference
10.1038/s41598-024-53048-6
10.1038/s41598-024-53048-6 · 2024 · External reference
10.1186/s12985-026-03072-x
10.1186/s12985-026-03072-x · 2026 · External reference
10.1016/j.vetvac.2022.100004
10.1016/j.vetvac.2022.100004 · 2022 · External reference
10.1007/s10989-018-9698-5
10.1007/s10989-018-9698-5 · 2019 · External reference
10.1021/bi300592c
10.1021/bi300592c · 2012 · External reference
10.6026/97320630012074
10.6026/97320630012074 · 2016 · External reference
10.1093/bioinformatics/11.6.681
10.1093/bioinformatics/11.6.681 · 1995 · External reference
10.3389/fimmu.2024.1380732
10.3389/fimmu.2024.1380732 · 2024 · External reference
10.3390/vaccines9121490
10.3390/vaccines9121490 · 2021 · External reference
10.1016/j.jgeb.2025.100524
10.1016/j.jgeb.2025.100524 · 2025 · External reference
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10.3390/microorganisms9112344 · 2021 · External reference
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10.3389/fmicb.2025.1534659 · 2025 · External reference
10.1186/s12967-025-06256-1
10.1186/s12967-025-06256-1 · 2025 · External reference
10.1093/nar/gki376
10.1093/nar/gki376 · 2005 · External reference
10.3390/microorganisms13051058
10.3390/microorganisms13051058 · 2025 · External reference
10.1038/s41598-024-73105-4
10.1038/s41598-024-73105-4 · 2024 · External reference
10.1093/nar/gkt458
10.1093/nar/gkt458 · 2013 · External reference
10.1002/(sici)1096-987x(199709)18:12<1463::aid-jcc4>3.0.co;2-h
10.1002/(sici)1096-987x(199709)18:12<1463::aid-jcc4>3.0.co;2-h · 1997 · External reference
10.1155/2018/1474517
10.1155/2018/1474517 · External reference
10.4081/ejtm.2018.7594
10.4081/ejtm.2018.7594 · External reference
10.4161/hv.28371
10.4161/hv.28371 · 2014 · External reference
10.1038/nmeth.4067
10.1038/nmeth.4067 · 2017 · External reference
10.1016/0263-7855(96)00018-5
10.1016/0263-7855(96)00018-5 · 1996 · External reference
10.1109/mcse.2007.55
10.1109/mcse.2007.55 · 2007 · External reference
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10.1002/prot.340110305 · 1991 · External reference
10.1016/j.compbiomed.2020.104203
10.1016/j.compbiomed.2020.104203 · 2021 · External reference
10.1038/s41598-021-03988-0
10.1038/s41598-021-03988-0 · 2022 · External reference
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10.3389/fimmu.2023.1280299 · 2023 · External reference
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10.1016/j.cell.2007.09.008 · 2007 · External reference
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10.1063/1.445869 · 1983 · External reference
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10.1038/s41598-020-67749-1 · 2020 · External reference
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10.1016/j.imu.2021.100578 · 2021 · External reference
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10.1038/s41598-026-45572-4 · 2026 · External reference
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10.1038/nprot.2016.169 · 2017 · External reference
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10.1006/jmbi.2000.4315 · 2001 · External reference
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10.3389/fmicb.2023.1251716 · 2023 · External reference
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10.1002/pro.3289 · 2018 · External reference
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10.1371/journal.pone.0104351 · 2014 · External reference
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10.1016/j.biopha.2024.116611 · 2024 · External reference
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10.1093/nar/gku339 · 2014 · External reference
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10.1097/inf.0000000000004571 · 2025 · External reference
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10.2147/idr.s448256 · 2024 · External reference
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10.1186/s42269-023-01013-0 · 2023 · External reference
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10.1371/journal.pone.0285177 · 2023 · External reference
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10.1128/ecosalplus.4.3.8 · External reference
10.1007/s00259-012-2175-z
10.1007/s00259-012-2175-z · 2012 · External reference
10.1093/nar/gkh435
10.1093/nar/gkh435 · 2004 · External reference
10.1038/s41592-022-01488-1
10.1038/s41592-022-01488-1 · 2022 · External reference
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10.1016/j.humimm.2024.110804 · 2024 · External reference
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10.1371/journal.pone.0335147 · 2025 · External reference
10.1080/07391102.2023.2178511
10.1080/07391102.2023.2178511 · 2023 · External reference
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10.3389/fimmu.2020.01663 · 2020 · External reference
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10.1146/annurev-biodatasci-021920-100259 · 2020 · External reference
10.24171/j.phrp.2024.0026
10.24171/j.phrp.2024.0026 · 2024 · External reference
10.1093/nar/gkab279
10.1093/nar/gkab279 · 2021 · External reference
10.1186/s12985-026-03099-0
10.1186/s12985-026-03099-0 · 2026 · External reference
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10.4049/jimmunol.1302101 · 2013 · External reference
10.1186/gb-2001-2-10-reviews2002 · Admitted local publication
10.1007/s10875-019-00642-3
10.1007/s10875-019-00642-3 · 2019 · External reference
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10.1186/1471-2105-9-514 · 2008 · External reference
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10.3389/fmicb.2022.880248 · 2022 · External reference
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10.1002/pro.2206 · 2013 · External reference
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10.1038/s41589-020-0575-0 · 2020 · External reference
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10.1002/prot.21078 · 2006 · External reference
10.1007/s00284-012-0245-x
10.1007/s00284-012-0245-x · 2013 · External reference
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10.1007/s13205-020-02574-x · 2021 · External reference
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10.1155/2014/402492 · External reference
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10.3390/healthcare11131946 · 2023 · External reference
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10.1016/j.imbio.2020.151955 · 2020 · External reference
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10.1016/j.nmni.2019.100516 · 2019 · External reference
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10.31557/apjcp.2024.25.11.4067 · 2024 · External reference
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10.1016/j.heliyon.2024.e34721 · 2024 · External reference
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10.1098/rstb.2015.0029 · 2015 · External reference
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10.1021/acs.jcim.1c01114 · 2021 · External reference
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10.4103/jgid.jgid_96_21 · 2022 · External reference
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10.3390/vaccines3030579 · 2015 · External reference
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10.3389/fmicb.2025.1546594 · 2025 · External reference
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10.7554/elife.97532.2 · 2025 · External reference
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10.1371/journal.pone.0244176 · 2020 · External reference
10.3389/fimmu.2022.887061
10.3389/fimmu.2022.887061 · 2022 · External reference
10.1093/nar/gkae1010
10.1093/nar/gkae1010 · 2025 · External reference
10.1111/j.1742-4658.2009.07156.x
10.1111/j.1742-4658.2009.07156.x · 2009 · External reference
10.7554/elife.07454
10.7554/elife.07454 · 2015 · External reference
10.3389/fimmu.2023.1043109
10.3389/fimmu.2023.1043109 · 2023 · External reference
10.1128/jb.02057-12
10.1128/jb.02057-12 · 2013 · External reference
10.1093/nar/gku938
10.1093/nar/gku938 · 2015 · External reference
10.1093/nar/gkae1092
10.1093/nar/gkae1092 · 2025 · External reference
10.1016/j.dib.2016.05.025
10.1016/j.dib.2016.05.025 · 2016 · External reference
10.1002/mco2.714
10.1002/mco2.714 · 2024 · External reference
10.1371/journal.pone.0072343
10.1371/journal.pone.0072343 · 2013 · External reference
10.1371/journal.pone.0072343
10.1371/journal.pone.0072343 · 2013 · External reference
10.3389/fmicb.2019.01236
10.3389/fmicb.2019.01236 · 2019 · External reference
10.3389/fmicb.2019.01236
10.3389/fmicb.2019.01236 · 2019 · External reference
10.1093/nar/gkm290
10.1093/nar/gkm290 · 2007 · External reference
10.1371/journal.pone.0023257
10.1371/journal.pone.0023257 · 2011 · External reference
10.1093/bioinformatics/btw514
10.1093/bioinformatics/btw514 · 2016 · External reference
10.1002/prot.21018
10.1002/prot.21018 · 2006 · External reference
10.1371/journal.pone.0099368
10.1371/journal.pone.0099368 · 2014 · External reference
10.1038/srep38577
10.1038/srep38577 · 2016 · External reference
10.1093/nar/gkn254
10.1093/nar/gkn254 · 2008 · External reference
10.3389/fmicb.2022.1086296
10.3389/fmicb.2022.1086296 · 2023 · External reference
10.46439/immunol.5.044
10.46439/immunol.5.044 · 2026 · External reference
10.1093/jac/dkx415
10.1093/jac/dkx415 · 2018 · External reference