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References from EEfinder, a general purpose tool for identification of bacterial and viral endogenized elements in eukaryotic genomes. Local targets link to admitted publications; unresolved targets remain external evidence.
10.1371/journal.pgen.1001191
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10.1073/pnas.1608979113
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10.1016/j.chom.2011.09.002
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10.1016/j.tree.2012.07.007
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10.1186/s12864-017-3903-3
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10.1098/rstb.2012.0493
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10.1371/journal.pgen.1004397
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10.7554/elife.41244
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10.3389/fgene.2020.542437
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10.1038/nrmicro.2017.137
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10.1038/35001608
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10.1146/annurev.genom.7.080505.115700
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10.1371/journal.pone.0187429
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10.3390/pathogens10010039
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10.1016/j.cub.2017.09.067
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10.3389/fmicb.2019.01139
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10.1186/s13100-022-00288-w
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10.1080/15384101.2015.1022696
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10.1371/journal.pone.0177119
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10.1073/pnas.1814589115
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10.1093/ve/vez010
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10.1186/1471-2105-10-421
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10.1038/s41592-021-01101-x
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10.1093/nar/gkq291
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10.1093/nar/gkg609
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10.1016/j.cois.2021.10.007
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10.1590/1678-4685-gmb-2022-0218
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10.1038/s41586-018-0692-z
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10.1128/jvi.02124-18
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10.1016/s0378-1119(01)00819-8
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10.1093/bib/bbx108
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10.1590/1678-4685-gmb-2023-0138
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