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References from Statistical methods for identifying differentially expressed genes in RNA-Seq experiments. Local targets link to admitted publications; unresolved targets remain external evidence.
10.1371/journal.pcbi.1000543
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10.1126/science.1103388
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10.1126/science.1108625
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10.1126/science.1088305
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10.1038/nbt1486
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10.1038/nrg2934
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10.1038/nrg2484
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10.1038/nrg3068
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10.1038/35087138
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10.1038/nrg1749
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10.1016/j.ymeth.2009.03.016
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10.1093/bioinformatics/18.4.546
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10.1186/gb-2010-11-10-r106
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10.1038/nmeth.1613
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10.1186/1471-2105-11-422
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10.1093/bioinformatics/btp113
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10.1093/nar/gkq041
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10.1038/nbt.1621
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10.1101/gr.079558.108
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10.1038/nmeth.1226
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10.1126/science.1158441
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10.1186/gb-2010-11-3-r25
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10.1093/bioinformatics/btm453
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10.1186/1471-2164-10-221
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10.1093/bioinformatics/btp616
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10.1093/bioinformatics/btr449
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10.1111/1467-9868.00346
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10.1073/pnas.1530509100
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10.1093/biomet/75.4.800
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10.1002/bimj.200710403
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10.1186/1471-2105-5-144
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10.1093/nar/gkn705
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10.1093/bioinformatics/btp677
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