Research graph
References from Clustered structural variant hotspots enable oncogenic addiction and plasticity in osteosarcoma. Local targets link to admitted publications; unresolved targets remain external evidence.
Osteosarcoma
10.1038/s41572-022-00409-y · 2022 · External reference
10.1002/pbc.24429
10.1002/pbc.24429 · External reference
10.1200/jco.2003.03.141
10.1200/jco.2003.03.141 · External reference
10.1056/nejmra2103423/suppl_file/nejmra2103423_disclosures.pdf
10.1056/nejmra2103423/suppl_file/nejmra2103423_disclosures.pdf · External reference
10.1016/j.celrep.2014.03.003
10.1016/j.celrep.2014.03.003 · External reference
The landscape of structural variation in pediatric cancer
10.1016/j.ccell.2026.02.012 · 2026 · External reference
10.1016/j.cell.2024.12.005
10.1016/j.cell.2024.12.005 · External reference
10.1038/ncomms15936
10.1038/ncomms15936 · External reference
10.1002/gcc.23253
10.1002/gcc.23253 · External reference
10.1158/2159-8290.cd-20-1230
10.1158/2159-8290.cd-20-1230 · External reference
10.1073/pnas.1419260111
10.1073/pnas.1419260111 · External reference
10.1038/s41586-020-1969-6
10.1038/s41586-020-1969-6 · External reference
10.1038/s41467-020-14646-w
10.1038/s41467-020-14646-w · External reference
10.64898/2026.06.10.731352
10.64898/2026.06.10.731352 · External reference
10.1093/bioinformatics/btv710
10.1093/bioinformatics/btv710 · External reference
10.1101/gr.221028.117
10.1101/gr.221028.117 · External reference
10.1038/s41586-020-1965-x
10.1038/s41586-020-1965-x · External reference
A practical framework and online tool for mutational signature analyses show intertissue variation and driver dependencies
10.1038/s43018-020-0027-5 · 2020 · External reference
10.1038/nature17676
10.1038/nature17676 · External reference
10.1038/s41586-020-03064-z
10.1038/s41586-020-03064-z · External reference
10.1038/s41586-024-08107-3
10.1038/s41586-024-08107-3 · External reference
10.1038/s41588-019-0576-7
10.1038/s41588-019-0576-7 · External reference
10.1038/s41467-018-08200-y
10.1038/s41467-018-08200-y · External reference
10.1016/j.cell.2015.04.004
10.1016/j.cell.2015.04.004 · External reference
10.1038/s41588-019-0564-y
10.1038/s41588-019-0564-y · External reference
10.1371/journal.pgen.1002772
10.1371/journal.pgen.1002772 · External reference
10.1038/s41392-024-02080-z
10.1038/s41392-024-02080-z · External reference
10.1158/2159-8290.cd-19-1390
10.1158/2159-8290.cd-19-1390 · External reference
10.1016/j.celrep.2022.111759
10.1016/j.celrep.2022.111759 · External reference
10.1016/j.humpath.2019.09.010
10.1016/j.humpath.2019.09.010 · External reference
10.1038/s41592-025-02857-2
10.1038/s41592-025-02857-2 · External reference
10.1016/j.cell.2017.10.024
10.1016/j.cell.2017.10.024 · External reference
10.1016/j.str.2010.12.014
10.1016/j.str.2010.12.014 · External reference
10.1523/jneurosci.2560-15.2015
10.1523/jneurosci.2560-15.2015 · External reference
10.1074/jbc.m708154200
10.1074/jbc.m708154200 · External reference
10.1016/j.cell.2023.07.036
10.1016/j.cell.2023.07.036 · External reference
10.1016/j.cell.2006.05.012
10.1016/j.cell.2006.05.012 · External reference
10.1016/j.devcel.2016.04.002
10.1016/j.devcel.2016.04.002 · External reference
10.1242/dev.00808
10.1242/dev.00808 · External reference
10.1016/s0896-6273(03)00163-6
10.1016/s0896-6273(03)00163-6 · External reference
10.1038/nature04684
10.1038/nature04684 · External reference
10.1016/j.ydbio.2010.05.012
10.1016/j.ydbio.2010.05.012 · External reference
Unresolved reference
External reference
10.1158/1538-7445.am2025-630
10.1158/1538-7445.am2025-630 · External reference
Prospective evaluation of pre-treatment ctDNA burden in localized osteosarcoma to identify patients with inferior outcomes: A report from the LEOPARD study
10.1200/jco.2024.42.16_suppl.11510 · 2024 · External reference
10.1038/s42003-020-0873-9
10.1038/s42003-020-0873-9 · External reference
10.1128/mcb.17.9.5227
10.1128/mcb.17.9.5227 · External reference
10.1128/mcb.20.10.3633-3639.2000
10.1128/mcb.20.10.3633-3639.2000 · External reference
10.1128/mcb.19.7.4672
10.1128/mcb.19.7.4672 · External reference
10.64898/2026.01.13.698472
10.64898/2026.01.13.698472 · External reference
Mapping the Single-Cell Differentiation Landscape of Osteosarcoma
10.1158/1078-0432.ccr-24-0563 · 2024 · External reference
Cancer cell plasticity during tumor progression, metastasis and response to therapy
10.1038/s43018-023-00595-y · 2023 · External reference
10.1016/j.hoc.2025.04.002
10.1016/j.hoc.2025.04.002 · External reference
10.1158/1535-7163.mct-20-0987
10.1158/1535-7163.mct-20-0987 · External reference
Detection of circulating tumor DNA in patients with osteosarcoma
10.18632/oncotarget.24268 · 2018 · External reference
10.1093/bioinformatics/btp324
10.1093/bioinformatics/btp324 · External reference
10.1038/nbt.2514
10.1038/nbt.2514 · External reference
10.1038/s41592-018-0051-x
10.1038/s41592-018-0051-x · External reference
10.1186/s13059-026-03971-w
10.1186/s13059-026-03971-w · External reference
10.1038/nbt.2203
10.1038/nbt.2203 · External reference
10.1038/s41598-019-45839-z
10.1038/s41598-019-45839-z · External reference
10.1016/j.cell.2016.12.025
10.1016/j.cell.2016.12.025 · External reference
10.1073/pnas.0912402107
10.1073/pnas.0912402107 · External reference
10.1093/nar/gkx951
10.1093/nar/gkx951 · External reference
10.1038/nbt1010-1045
10.1038/nbt1010-1045 · External reference
Unresolved reference
External reference
10.1093/nar/gkaf1250
10.1093/nar/gkaf1250 · External reference
10.1186/s12864-018-5330-5
10.1186/s12864-018-5330-5 · External reference
10.1101/2021.10.28.466333
10.1101/2021.10.28.466333 · External reference
10.1093/nar/gky1015
10.1093/nar/gky1015 · External reference
A practical framework and online tool for mutational signature analyses show intertissue variation and driver dependencies
10.1038/s43018-020-0027-5 · 2020 · External reference
10.1093/bioinformatics/btad719
10.1093/bioinformatics/btad719 · External reference
Unresolved reference
External reference
10.1093/bioinformatics/btx346
10.1093/bioinformatics/btx346 · External reference
10.1038/s41467-018-08200-y
10.1038/s41467-018-08200-y · External reference
10.1101/2024.05.06.592768
10.1101/2024.05.06.592768 · External reference
10.1093/nar/gkae1078
10.1093/nar/gkae1078 · External reference
10.1038/nature11247
10.1038/nature11247 · External reference
10.1186/s13059-019-1836-7
10.1186/s13059-019-1836-7 · External reference
10.1038/s41586-020-1943-3
10.1038/s41586-020-1943-3 · External reference
10.1200/cci.21.00144
10.1200/cci.21.00144 · External reference
10.1158/2159-8290.cd-23-0467
10.1158/2159-8290.cd-23-0467 · External reference
10.1200/po.17.00011
10.1200/po.17.00011 · External reference
10.1038/nature12912
10.1038/nature12912 · External reference
10.1038/s41592-020-0905-x
10.1038/s41592-020-0905-x · External reference
10.1093/bioinformatics/bts635
10.1093/bioinformatics/bts635 · External reference
10.1186/1471-2105-12-323
10.1186/1471-2105-12-323 · External reference
10.1093/bioinformatics/btad547
10.1093/bioinformatics/btad547 · External reference
10.1101/2024.04.19.590243
10.1101/2024.04.19.590243 · External reference
10.1038/s41592-025-02857-2
10.1038/s41592-025-02857-2 · External reference
10.7554/elife.43803
10.7554/elife.43803 · External reference
The Molecular Signatures Database Hallmark Gene Set Collection
10.1016/j.cels.2015.12.004 · 2015 · External reference
10.1038/nmeth.4463
10.1038/nmeth.4463 · External reference
10.1016/j.cell.2018.01.029
10.1016/j.cell.2018.01.029 · External reference
10.1038/s41467-017-00965-y
10.1038/s41467-017-00965-y · External reference
10.64898/2026.03.23.26349081
10.64898/2026.03.23.26349081 · External reference
10.1002/gcc.23253
10.1002/gcc.23253 · ExternalCitation · doi-reference
10.1002/pbc.24429
10.1002/pbc.24429 · ExternalCitation · doi-reference
The landscape of structural variation in pediatric cancer
10.1016/j.ccell.2026.02.012 · ExternalCitation · doi-reference
10.1016/j.cell.2006.05.012
10.1016/j.cell.2006.05.012 · ExternalCitation · doi-reference
10.1016/j.cell.2015.04.004
10.1016/j.cell.2015.04.004 · ExternalCitation · doi-reference
10.1016/j.cell.2016.12.025
10.1016/j.cell.2016.12.025 · ExternalCitation · doi-reference
10.1016/j.cell.2017.10.024
10.1016/j.cell.2017.10.024 · ExternalCitation · doi-reference
10.1016/j.cell.2018.01.029
10.1016/j.cell.2018.01.029 · ExternalCitation · doi-reference
10.1016/j.cell.2023.07.036
10.1016/j.cell.2023.07.036 · ExternalCitation · doi-reference
10.1016/j.cell.2024.12.005
10.1016/j.cell.2024.12.005 · ExternalCitation · doi-reference
10.1016/j.celrep.2014.03.003
10.1016/j.celrep.2014.03.003 · ExternalCitation · doi-reference
10.1016/j.celrep.2022.111759
10.1016/j.celrep.2022.111759 · ExternalCitation · doi-reference
The Molecular Signatures Database Hallmark Gene Set Collection
10.1016/j.cels.2015.12.004 · ExternalCitation · doi-reference
10.1016/j.devcel.2016.04.002
10.1016/j.devcel.2016.04.002 · ExternalCitation · doi-reference
10.1016/j.hoc.2025.04.002
10.1016/j.hoc.2025.04.002 · ExternalCitation · doi-reference
10.1016/j.humpath.2019.09.010
10.1016/j.humpath.2019.09.010 · ExternalCitation · doi-reference
10.1016/j.str.2010.12.014
10.1016/j.str.2010.12.014 · ExternalCitation · doi-reference
10.1016/j.ydbio.2010.05.012
10.1016/j.ydbio.2010.05.012 · ExternalCitation · doi-reference
10.1016/s0896-6273(03)00163-6
10.1016/s0896-6273(03)00163-6 · ExternalCitation · doi-reference
10.1038/nature04684
10.1038/nature04684 · ExternalCitation · doi-reference
10.1038/nature11247
10.1038/nature11247 · ExternalCitation · doi-reference
10.1038/nature12912
10.1038/nature12912 · ExternalCitation · doi-reference
10.1038/nature17676
10.1038/nature17676 · ExternalCitation · doi-reference
10.1038/nbt.2203
10.1038/nbt.2203 · ExternalCitation · doi-reference
10.1038/nbt.2514
10.1038/nbt.2514 · ExternalCitation · doi-reference
10.1038/nbt1010-1045
10.1038/nbt1010-1045 · ExternalCitation · doi-reference
10.1038/ncomms15936
10.1038/ncomms15936 · ExternalCitation · doi-reference
10.1038/nmeth.4463
10.1038/nmeth.4463 · ExternalCitation · doi-reference
10.1038/s41392-024-02080-z
10.1038/s41392-024-02080-z · ExternalCitation · doi-reference
10.1038/s41467-017-00965-y
10.1038/s41467-017-00965-y · ExternalCitation · doi-reference
10.1038/s41467-018-08200-y
10.1038/s41467-018-08200-y · ExternalCitation · doi-reference
10.1038/s41467-020-14646-w
10.1038/s41467-020-14646-w · ExternalCitation · doi-reference
Osteosarcoma
10.1038/s41572-022-00409-y · ExternalCitation · doi-reference
10.1038/s41586-020-03064-z
10.1038/s41586-020-03064-z · ExternalCitation · doi-reference
10.1038/s41586-020-1943-3
10.1038/s41586-020-1943-3 · ExternalCitation · doi-reference
10.1038/s41586-020-1965-x
10.1038/s41586-020-1965-x · ExternalCitation · doi-reference
10.1038/s41586-020-1969-6
10.1038/s41586-020-1969-6 · ExternalCitation · doi-reference
10.1038/s41586-024-08107-3
10.1038/s41586-024-08107-3 · ExternalCitation · doi-reference
10.1038/s41588-019-0564-y
10.1038/s41588-019-0564-y · ExternalCitation · doi-reference
10.1038/s41588-019-0576-7
10.1038/s41588-019-0576-7 · ExternalCitation · doi-reference
10.1038/s41592-018-0051-x
10.1038/s41592-018-0051-x · ExternalCitation · doi-reference
10.1038/s41592-020-0905-x
10.1038/s41592-020-0905-x · ExternalCitation · doi-reference
10.1038/s41592-025-02857-2
10.1038/s41592-025-02857-2 · ExternalCitation · doi-reference
10.1038/s41598-019-45839-z
10.1038/s41598-019-45839-z · ExternalCitation · doi-reference
10.1038/s42003-020-0873-9
10.1038/s42003-020-0873-9 · ExternalCitation · doi-reference
A practical framework and online tool for mutational signature analyses show intertissue variation and driver dependencies
10.1038/s43018-020-0027-5 · ExternalCitation · doi-reference
Cancer cell plasticity during tumor progression, metastasis and response to therapy
10.1038/s43018-023-00595-y · ExternalCitation · doi-reference
10.1056/nejmra2103423/suppl_file/nejmra2103423_disclosures.pdf
10.1056/nejmra2103423/suppl_file/nejmra2103423_disclosures.pdf · ExternalCitation · doi-reference
10.1073/pnas.0912402107
10.1073/pnas.0912402107 · ExternalCitation · doi-reference
10.1073/pnas.1419260111
10.1073/pnas.1419260111 · ExternalCitation · doi-reference
10.1074/jbc.m708154200
10.1074/jbc.m708154200 · ExternalCitation · doi-reference
10.1093/bioinformatics/btad547
10.1093/bioinformatics/btad547 · ExternalCitation · doi-reference
10.1093/bioinformatics/btad719
10.1093/bioinformatics/btad719 · ExternalCitation · doi-reference
10.1093/bioinformatics/btp324
10.1093/bioinformatics/btp324 · ExternalCitation · doi-reference
10.1093/bioinformatics/bts635
10.1093/bioinformatics/bts635 · ExternalCitation · doi-reference
10.1093/bioinformatics/btv710
10.1093/bioinformatics/btv710 · ExternalCitation · doi-reference
10.1093/bioinformatics/btx346
10.1093/bioinformatics/btx346 · ExternalCitation · doi-reference
10.1093/nar/gkae1078
10.1093/nar/gkae1078 · ExternalCitation · doi-reference
10.1093/nar/gkaf1250
10.1093/nar/gkaf1250 · ExternalCitation · doi-reference
10.1093/nar/gkx951
10.1093/nar/gkx951 · ExternalCitation · doi-reference
10.1093/nar/gky1015
10.1093/nar/gky1015 · ExternalCitation · doi-reference
10.1101/2021.10.28.466333
10.1101/2021.10.28.466333 · ExternalCitation · doi-reference
10.1101/2024.04.19.590243
10.1101/2024.04.19.590243 · ExternalCitation · doi-reference
10.1101/2024.05.06.592768
10.1101/2024.05.06.592768 · ExternalCitation · doi-reference
10.1101/gr.221028.117
10.1101/gr.221028.117 · ExternalCitation · doi-reference
10.1128/mcb.17.9.5227
10.1128/mcb.17.9.5227 · ExternalCitation · doi-reference
10.1128/mcb.19.7.4672
10.1128/mcb.19.7.4672 · ExternalCitation · doi-reference
10.1128/mcb.20.10.3633-3639.2000
10.1128/mcb.20.10.3633-3639.2000 · ExternalCitation · doi-reference
Mapping the Single-Cell Differentiation Landscape of Osteosarcoma
10.1158/1078-0432.ccr-24-0563 · ExternalCitation · doi-reference
10.1158/1535-7163.mct-20-0987
10.1158/1535-7163.mct-20-0987 · ExternalCitation · doi-reference
10.1158/1538-7445.am2025-630
10.1158/1538-7445.am2025-630 · ExternalCitation · doi-reference
10.1158/2159-8290.cd-19-1390
10.1158/2159-8290.cd-19-1390 · ExternalCitation · doi-reference
10.1158/2159-8290.cd-20-1230
10.1158/2159-8290.cd-20-1230 · ExternalCitation · doi-reference
10.1158/2159-8290.cd-23-0467
10.1158/2159-8290.cd-23-0467 · ExternalCitation · doi-reference
10.1186/1471-2105-12-323
10.1186/1471-2105-12-323 · ExternalCitation · doi-reference
10.1186/s12864-018-5330-5
10.1186/s12864-018-5330-5 · ExternalCitation · doi-reference
10.1186/s13059-019-1836-7
10.1186/s13059-019-1836-7 · ExternalCitation · doi-reference
10.1186/s13059-026-03971-w
10.1186/s13059-026-03971-w · ExternalCitation · doi-reference
10.1200/cci.21.00144
10.1200/cci.21.00144 · ExternalCitation · doi-reference
10.1200/jco.2003.03.141
10.1200/jco.2003.03.141 · ExternalCitation · doi-reference
Prospective evaluation of pre-treatment ctDNA burden in localized osteosarcoma to identify patients with inferior outcomes: A report from the LEOPARD study
10.1200/jco.2024.42.16_suppl.11510 · ExternalCitation · doi-reference
10.1200/po.17.00011
10.1200/po.17.00011 · ExternalCitation · doi-reference
10.1242/dev.00808
10.1242/dev.00808 · ExternalCitation · doi-reference
10.1371/journal.pgen.1002772
10.1371/journal.pgen.1002772 · ExternalCitation · doi-reference
10.1523/jneurosci.2560-15.2015
10.1523/jneurosci.2560-15.2015 · ExternalCitation · doi-reference
Detection of circulating tumor DNA in patients with osteosarcoma
10.18632/oncotarget.24268 · ExternalCitation · doi-reference
10.64898/2026.01.13.698472
10.64898/2026.01.13.698472 · ExternalCitation · doi-reference
10.64898/2026.03.23.26349081
10.64898/2026.03.23.26349081 · ExternalCitation · doi-reference
10.64898/2026.06.10.731352
10.64898/2026.06.10.731352 · ExternalCitation · doi-reference
10.7554/elife.43803
10.7554/elife.43803 · ExternalCitation · doi-reference
