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10.1016/s0092-8674(01)00542-6 · External reference
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10.1128/mcb.24.6.2478-2486.2004 · External reference
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10.1242/dev.127.13.2955 · External reference
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10.1038/nature08674 · External reference
10.1016/0092-8674(92)90611-f
10.1016/0092-8674(92)90611-f · External reference
10.1016/s0092-8674(00)81656-6
10.1016/s0092-8674(00)81656-6 · External reference
10.1093/emboj/cdg288
10.1093/emboj/cdg288 · External reference
10.1093/hmg/ddw243
10.1093/hmg/ddw243 · External reference
10.1083/jcb.147.5.913
10.1083/jcb.147.5.913 · External reference
10.4161/nucl.2.3.15731 · Admitted local publication
10.1146/annurev-biochem-020425-045352
10.1146/annurev-biochem-020425-045352 · External reference
10.1007/s00335-014-9516-0
10.1007/s00335-014-9516-0 · External reference
The epigenetic modifier Fam208a is required to maintain epiblast cell fitness
10.1038/s41598-017-09490-w · 2017 · External reference
10.1126/sciadv.abo7247
10.1126/sciadv.abo7247 · External reference
10.1002/dvg.20553
10.1002/dvg.20553 · External reference
Interplay between two paralogous Human Silencing Hub (HuSH) complexes in regulating LINE-1 element silencing
10.1038/s41467-024-53761-w · 2024 · External reference
10.1002/dvg.20296
10.1002/dvg.20296 · External reference
10.1073/pnas.95.23.13709
10.1073/pnas.95.23.13709 · External reference
10.1038/nature21715
10.1038/nature21715 · External reference
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10.1128/mcb.25.8.2995-3006.2005 · External reference
10.1038/s41586-024-07081-0
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10.1038/383250a0 · External reference
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10.1371/journal.pone.0025174 · External reference
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10.1101/gad.9.10.1211 · External reference
10.1016/s0925-4773(99)00100-8
10.1016/s0925-4773(99)00100-8 · External reference
10.1128/mcb.00259-10
10.1128/mcb.00259-10 · External reference
10.1002/dvdy.21070
10.1002/dvdy.21070 · External reference
10.1038/ng.3272
10.1038/ng.3272 · External reference
10.1186/s13072-016-0069-1
10.1186/s13072-016-0069-1 · External reference
10.1371/journal.pgen.1002964
10.1371/journal.pgen.1002964 · External reference
10.1093/jmcb/mjv003
10.1093/jmcb/mjv003 · External reference
Observations on a set of radiation-induced dominant T-like mutations in the mouse
10.1017/s0016672300015883 · 1975 · External reference
A new spontaneous deletion on chromosome 17 including brachyury
10.1007/s003359900614 · 1997 · External reference
10.1006/dbio.1994.1019
10.1006/dbio.1994.1019 · External reference
10.1038/nature03813
10.1038/nature03813 · External reference
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10.1242/dev.01711 · External reference
10.1128/mcb.26.1.77-87.2006
10.1128/mcb.26.1.77-87.2006 · External reference
10.1016/j.devcel.2020.11.013
10.1016/j.devcel.2020.11.013 · External reference
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10.1101/gad.1649908
10.1101/gad.1649908 · External reference
10.1038/nrm.2017.87
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10.1038/s41419-020-02860-9
10.1038/s41419-020-02860-9 · External reference
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10.1371/journal.pgen.0020066 · External reference
10.1093/hmg/ddi117
10.1093/hmg/ddi117 · External reference
10.1073/pnas.0308531101
10.1073/pnas.0308531101 · External reference
10.1126/science.1179050
10.1126/science.1179050 · External reference
10.1016/j.tig.2022.12.005
10.1016/j.tig.2022.12.005 · External reference
10.1038/s41580-021-00398-y
10.1038/s41580-021-00398-y · External reference
10.1242/dev.081661
10.1242/dev.081661 · External reference
10.7554/elife.00205
10.7554/elife.00205 · External reference
10.1126/science.abc3393
10.1126/science.abc3393 · External reference
10.1038/s41576-018-0073-3
10.1038/s41576-018-0073-3 · External reference
10.1016/j.devcel.2021.10.010
10.1016/j.devcel.2021.10.010 · External reference
10.1016/j.cell.2013.04.022
10.1016/j.cell.2013.04.022 · External reference
10.1038/ng.2836
10.1038/ng.2836 · External reference
10.1186/s13059-018-1390-8
10.1186/s13059-018-1390-8 · External reference
10.1126/science.abn1430
10.1126/science.abn1430 · External reference
10.1186/s13059-024-03184-z
10.1186/s13059-024-03184-z · External reference
Host gene regulation by transposable elements: The New, the Old and the Ugly
10.3390/v12101089 · 2020 · External reference
10.1093/bioinformatics/bts635
10.1093/bioinformatics/bts635 · External reference
10.1101/2021.05.05.442755
10.1101/2021.05.05.442755 · External reference
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10.1101/gr.228171.117
10.1101/gr.228171.117 · External reference
Genome surveillance by HUSH-mediated silencing of intronless mobile elements
2021 · External reference
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10.1038/nature25179 · External reference
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10.1016/j.celrep.2024.114887 · External reference
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10.1038/s41467-024-50765-4 · External reference
10.1016/j.stem.2016.03.013
10.1016/j.stem.2016.03.013 · External reference
Developmental chronology of mouse embryo from 2-cell stage through birth
10.1038/s41556-026-01971-3 · 2026 · External reference
10.1038/s41576-020-0251-y
10.1038/s41576-020-0251-y · External reference
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10.1016/j.tig.2017.08.006 · External reference
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10.1038/ncomms1248 · External reference
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10.1371/journal.pgen.1000311 · External reference
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10.7208/chicago/9780226256573.001.0001 · External reference
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10.1038/nature14308 · External reference
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10.1038/s41559-017-0072 · External reference
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External reference
10.1038/s41587-023-01767-y
10.1038/s41587-023-01767-y · External reference
Scrublet: Computational identification of cell Doublets in Single-cell transcriptomic data
10.1016/j.cels.2018.11.005 · 2019 · External reference
SNPsplit: Allele-specific splitting of alignments between genomes with known SNP genotypes
10.12688/f1000research.9037.1 · 2016 · External reference
10.21105/joss.00861
10.21105/joss.00861 · External reference
Unresolved reference
External reference
10.1186/1471-2105-10-232
10.1186/1471-2105-10-232 · External reference
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External reference
10.1093/nar/gkw377
10.1093/nar/gkw377 · External reference
10.1093/bioinformatics/btac757
10.1093/bioinformatics/btac757 · External reference
10.1186/s13059-014-0550-8
10.1186/s13059-014-0550-8 · External reference
10.1186/gb-2014-15-2-r38
10.1186/gb-2014-15-2-r38 · External reference
10.1186/s13100-020-00230-y
10.1186/s13100-020-00230-y · External reference
10.1038/s41467-021-21808-x
10.1038/s41467-021-21808-x · External reference
IRescue: uncertainty-aware quantification of transposable elements expression at single cell level
10.1093/nar/gkae793 · 2024 · External reference
10.1093/bioinformatics/btv422
10.1093/bioinformatics/btv422 · External reference
10.1093/nar/gkw257
10.1093/nar/gkw257 · External reference
10.1093/bioinformatics/btaa692
10.1093/bioinformatics/btaa692 · External reference
10.1186/s13059-017-1382-0
10.1186/s13059-017-1382-0 · External reference
10.1038/s41587-020-0591-3
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10.1038/s41467-019-09182-1
10.1038/s41467-019-09182-1 · External reference
10.1007/bf01731581
10.1007/bf01731581 · External reference
10.1016/j.celrep.2015.06.067
10.1016/j.celrep.2015.06.067 · External reference
10.1016/j.cell.2015.03.025
10.1016/j.cell.2015.03.025 · External reference
10.1038/s41594-022-00739-1
10.1038/s41594-022-00739-1 · External reference
10.1186/1471-2105-14-128
10.1186/1471-2105-14-128 · External reference
10.1038/s41588-018-0218-5
10.1038/s41588-018-0218-5 · External reference